久坂玄瑞等人都是长州藩的名士，对此次行刺志在必得。就算谋刺不成，也可以从容撤退。

然而，一开始就非常不顺。革命军卫队火力很猛，久坂玄瑞等人被步枪、手枪压制得抬不起头，很快就有两人中弹身亡。久坂玄瑞既是吉田松阴的弟子，也是他的女婿，对吉田松阴最为忠诚，行刺之心最为坚决。

但在革命军绝对的火力面前，武士的勇气根本不值不提。不仅久坂玄瑞等人动弹不得，高山晋作这组奇兵亦无法得到掩护，不能进入公使馆。

更多的革命军卫队反应过来，或守卫大门，或在阳台上居高临下，瞄准武士射击。

武士们才一露头，就被卫队步枪、手枪打得死伤惨重。再拖下去，武士就要全军覆没了。

久坂玄瑞大喝一声：“扔火弹！”这些火弹数量有限，本打算等冲入使馆内后再使用。如今情况紧急，只能把珍贵的手榴弹扔出来，以制造混乱。

围墙上的两名武士，已被铁丝网刺得血肉模糊，亦跌跌撞撞地冲向公使馆大门。按计划，他们负责守卫围墙，接应刺客撤退。

他们见同袍有难，擅离围墙，就意味着大家已无退路，只能与敌人同归于尽。这两个武士行动不便，目标暴露，很快被革命军卫队击毙。

众武士悲从心起，把手中的火弹用力抛出。趁着火弹造成的混乱，久坂玄瑞击中了一盏煤气灯。煤气灯爆炸，使馆少了一盏煤气灯，院子晦暗不少。

久坂玄瑞趁机带队冲向公使馆大门，与中国卫兵近战格斗。高山晋作则率领着奇兵组，与伊藤博文等残存的四人砸破窗户，直奔二楼而去。

楼道里灯火已灭，高山晋作刚刚冲上二楼，一名卫兵抢了过来，举枪瞄准为首的高山晋作。砰得一声，高山晋作中弹，跌倒在地。

卫兵亦非常悍勇，穿过高山晋作，试图堵住楼梯，防止武士上窜。谁知道，高山晋作没有死，抽出武士刀砍中了卫兵的大腿。卫兵吃痛，跪倒在地，顺手击毙高山晋作。

伊藤博文则赶了上来，一刀劈死卫兵。他只有16岁，却从小刻苦训练，已是一名武艺高强、勇敢无畏的武士。但他经验不足，有勇无谋，捡起枪支就往前冲。

卫兵的勇猛，为二楼的卫兵赢得了时间。就在这短短的几十秒内，二楼的卫兵已经各就各位，完成了部署。伊藤博文正要向上攀爬，就被乱枪打成了筛子。

奇兵组还剩两名武士，但高山晋作已死，奇兵组群龙无首，已经无能为力。二楼灯火全灭，只剩楼道里还有残存灯光。两名武士心智已乱，不顾一切地冲了上去。

卫兵守在楼道两旁，听到急促的脚步声后，从楼道两侧闪出，乱枪打死了两名武士。

一分钟后，二楼再无动静。二楼卫兵留下五人守卫楼道，其余四人冲下一楼，会同一楼的卫兵，阻击来访的刺客。

卫兵皆为百战之余的革命军老兵，使用口哨传递口令，彼此密切配合，顺利全歼日本武士。

参与刺杀行动的长洲籍武士共用有十六名，被击毙十三名，两名重伤，一名轻伤。